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POSGRADO EN MICROBIOLOGÍA, PARASITOLOGÍA, QUÍMICA CLÍNICA E INMUNOLOGÍA

PRESENTACION


Inicia como el primer programa de posgrado de la Universidad de Costa Rica y está reconocido como un programa regional en el ámbito centroamericano. Desde su ingreso al programa, los estudiantes se incorporan a proyectos en centros de investigación de la Universidad y de otras instituciones de gran relevancia nacional e internacional. La mayoría de los docentes del programa son graduados de universidades europeas o norteamericanas. 

Nuestra meta es educar y formar científicos y profesionales altamente calificados en Microbiología básica para que se desempeñen en el campo académico, clínico e industrial con el fin de que puedan contribuir a desarrollar nuevo conocimiento y a resolver problemas de importancia en esta área del saber.

ACTIVIDADES ACADÉMICAS

Actividades pasada

MINI TALLER: CÓMO OBTENER INFORMACIÓN ESTRUCTURAL DE PROTEÍNAS

INVESTIGACIONES Y PUBLICACIONES DE NUESTROS ESTUDIANTES

TESIS

 

Expresión de genes que codifican por proteínas proinflamatorias y de resolución de la inflamación en casos de periodontitis   Estudiante: Alberto Vega Chin

Resumen de la tesis

La periodontitis es una enfermedad inflamatoria crónica vinculada con biopelículas de la placa disbiótica y caracterizada por la destrucción progresiva del aparato de soporte dental. La biopelícula patogénica es un prerrequisito necesario de la periodontitis, pero no es suficiente para ocasionarla. La interacción compleja entre la biopelícula y la respuesta inmune inflamatoria lleva a la enfermedad. Se estima que un 80% del riesgo del daño tisular es debido a la respuesta inflamatoria. Se observan pacientes que reaccionan y ejecutan una respuesta inflamatoria destructiva mediante la biopelícula dental. La regulación alterada de moduladores inmunológicos, como las citoquinas, puede estimular o acelerar la periodontitis. Los niveles de reducción de la biopelícula, indispensables para recuperar la simbiosis, suelen ser distintos entre pacientes. La búsqueda de nuevos manejos terapéuticos integrales de las enfermedades periodontales beneficiaría a los pacientes, pero es necesario comprender los mecanismos del sistema inmune subyacentes de la enfermedad. Determinar el perfil de expresión de genes que codifican proteínas resolutivas de la inflamación tiene el potencial de ilustrar ciertos aspectos de estos mecanismos. Este proyecto de investigación evaluó el perfil de expresión de genes que codifican para proteínas involucradas con la periodontitis en muestras de tejido conectivo gingival provenientes de pacientes con periodontitis y de pacientes sin periodontitis. Además, determinó la asociación entre la expresión de genes que codifican proteínas involucradas con la periodontitis y la manifestación clínica de la enfermedad. El estudio se realizó en coordinación entre el Centro de Investigación de Biología Celular y Molecular (CIBCM) y la Clínica de Énfasis de Periodoncia de la Facultad de Odontología, ambas pertenecientes a la Universidad de Costa Rica (UCR). La población participante fueron pacientes tratados en la Clínica de Énfasis de Periodoncia de la Facultad de Odontología de la UCR entre el 25 de agosto del 2017 al 14 de febrero del 2020. Se tomaron muestras de tejido conectivo gingival de pacientes con periodontitis y de pacientes sin periodontitis. Se utilizó la técnica de una RT-qPCR y se cuantificaron los genes que codifican para las proteínas de interés: IL-1α, IL-1β, IL-17A, TNF-α, COX2, LTA, TLR2, TLR4, FPR1, CXCL8, TYRO3, AXL, MERTK, GAS6, PROS1, ANXA1, FPR2, IL-10, TGFBR1, IgG1, IgG3, MMP2, MMP3, MMP9, MMP12, TIMP1 y tPA. No se observaron diferencias significativas. Sin embargo, al realzar una clasificación mediante regresión logística, los genes que codifican por las proteínas proinflamatorias IL-1α, IL-1β, TNF-α, COX-2, LTA, el receptor FPR1, la quimiocina CXCL8, los receptores TYRO3, AXL, MERTK y el ligando GAS6, ANXA1 y el receptor FPR2, el receptor TGFBR1, las inmunoglobulinas IgG1e IgG3, y las MMP-2, MMP12 y TIMP-1 logran tener una sensibilidad para poder predecir un caso de periodontitis de 88.46 %. Este trabajo abre la posibilidad de aplicar herramientas moleculares en la práctica profesional para la detección de casos de periodontitis. 

TESIS

 

Optimización de la fermentación de Trichoderma asperellum para la producción y caracterización de peptaiboles con potencial efecto antimicrobiano contra patógenos alimentarios.   Estudiante: Alisson Bastos Salas

Resumen de la tesis

Las Enfermedades Transmitidas por Alimentos (ETA) son causadas por microorganismos y sustancias químicas en diversas matrices alimenticias. Estas enfermedades son una problemática a nivel mundial, ya que afectan la salud de la población y el desarrollo socioeconómico.. En la búsqueda de nuevas estrategias para la prevención de las ETAs, Trichoderma asperellum surge como productor de un grupo de péptidos bioactivos llamados peptaiboles. Estos poseen actividad antimicrobiana contra hongos y bacterias de diversos géneros. No obstante, una de las limitaciones para su producción es el bajo rendimiento y el escalamiento del proceso fermentativo. Por esta razón, se realizaron pruebas en matraz para determinar el efecto de la adición de aminoácidos, elicitores fúngicos y azúcares sobre la producción de peptaiboles. Luego, se optimizaron las concentraciones mediante un modelo central compuesto. Finalmente, se caracterizó la secuencia de los peptaiboles obtenidos por medio de espectrometría de masas y su actividad antimicrobiana. Se determinó que la adición de sacarosa, Aib y restos celulares de Fusarium oxysporum generaron más peptaiboles, y se obtuvo la concentración óptima de los últimos. Se evidenció la producción de las tricotoxinas T5D2, 1690, 1703A, A-40 y 1717A. Finalmente, se determinó la actividad antimicrobiana ante las bacterias Escherichia coli ATCC 25922 y Lactobacillus paracasei G714 Los resultados obtenidos demuestran que este proceso se puede optimizar y que estos metabolitos bioactivos son una potencial herramienta para el control de microorganismos bacterianos de importancia para la industria alimentaria.

TESIS

 

“Caracterización bioquímica y biológica de inhibidores endógenos de veneno presentes en el plasma de la serpiente Crotalus simus (Serpentes: Viperidae)”.   Estudiante: Arturo Chang Castillo

Resumen de la tesis

Las serpientes venenosas presentan una mezcla compleja de toxinas de origen proteico con diferentes actividades farmacológicas. Un mecanismo de resistencia que las serpientes y otros organismos presentan contra estas toxinas es la síntesis de inhibidores plasmáticos que neutralizan las actividades de estas toxinas. En este estudio se utilizó un enfoque basado en cromatografía, electroforesis y proteómica para separar e identificar una fracción de inhibidores a partir del plasma de la serpiente cascabel neotropical, Crotalus simus. También se utilizó una batería de pruebas para probar si tienen actividad neutralizante contra las actividades del veneno de esta serpiente. Y por último se comparó la actividad neutralizante de estos inhibidores con el suero antiofídico comercial PoliVal-ICP. Se obtuvo una fracción de proteínas plasmáticas que se identificaron parcialmente por espectrometría de masas en tándem como inhibidores de fosfolipasa A2 tipo gamma (γPLI). Esta fracción neutralizó las actividades letal, miotóxica y coagulante del veneno de C. simus, pero no las actividadesdesfibrinogenante, hemorrágica ni proteolítica. En comparación con el suero PoliVal-ICP, los inhibidores son más potentes en neutralizar la actividad letal del veneno, si se considera la masa de proteína inyectada en los ratones. Pero el suero es más versátil que los inhibidores, ya que neutraliza todas las actividades del veneno. Se concluye que los inhibidores de fosfolipasa A2 identificados son eficaces en neutralizar la letalidad del veneno de esta especie de serpiente porque neutralizan las fosfolipasas A2

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POSGRADO EN MICROBIOLOGÍA, PARASITOLOGÍA, QUÍMICA CLÍNICA E INMUNOLOGÍA


Dr. Carlos Chacón Díaz, Director del Programa

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