El plan de estudios consta de 61 créditos y está organizado de la siguiente manera:
- Investigación práctica aplicada en los instrumentos, 20 créditos. Cada estudiante trabajará de forma individual con el (la) profesor(a) de instrumento para el perfeccionamiento de la técnica instrumental y aplicando además los conocimientos que los otros cursos le ofrecen para la interpretación de alto nivel.
- Historia y teoría musical, 16 créditos. Son los cursos propios del énfasis y comunes a todos los estudiantes. En ellos se estudian aspectos teóricos e históricos propios del mundo de la música.
- Curso de técnicas de investigación, 4 créditos. Es un curso que le servirá de herramienta para la elaboración de trabajos escritos, y además introducirá al estudiante para que pueda desarrollar una investigación en el ámbito de la música.
- Cursos electivos, 9 créditos. El Programa invita a profesores nacionales e internacionales a impartir cursos en el área, y que enriquezcan la formación de los músicos.
- Cursos humanísticos, 9 créditos. Desarrollan perspectivas teóricas pertinentes para la comprensión del arte como producción simbólica y fenómeno sociocultural.
Los énfasis se dan en los siguientes instrumentos: Arpa, Guitarra, Eufonio, Clave, Piano,Tuba, Corno,Trompeta, Saxofón, Flauta, Violín, Clavicémbalo, Precusión, Clarinete, Oboe, Trombón, Contrabajo, Violoncello, Viola, Fagot.