Inicia como el primer programa de posgrado de la Universidad de Costa Rica y está reconocido como un programa regional en el ámbito centroamericano. Desde su ingreso al programa, los estudiantes se incorporan a proyectos en centros de investigación de la Universidad y de otras instituciones de gran relevancia nacional e internacional. La mayoría de los docentes del programa son graduados de universidades europeas o norteamericanas.
Nuestra meta es educar y formar científicos y profesionales altamente calificados en Microbiología básica para que se desempeñen en el campo académico, clínico e industrial con el fin de que puedan contribuir a desarrollar nuevo conocimiento y a resolver problemas de importancia en esta área del saber.